DNA-ekstraktion (jordbær)

Biologi C · STX · C-niveau · Eksperimentelt arbejde

🧬 DNA-ekstraktion (jordbær)

DNA-ekstraktion = klassisk skole-eksperiment der visualiserer DNA.

Princip: bryd celle + kerne-membraner → frigør DNA → udfæld med alkohol så det bliver SYNLIGT (hvidt slim).

Hvorfor jordbær?: jordbær er OCTOPLOID (8 kromosom-sæt!) — ekstra meget DNA per celle. Lette frugt-vægger gør det lettere at knuse.

Materialer:

• (a) 1-2 jordbær (eller ½ banan, eller 1 kiwi, eller løg).
• (b) Lyseringsbuffer — 100 ml lunkent vand + 1 tsk salt + 2-3 spsk opvaskemiddel (fx Yes!).
• (c) Iskold ethanol 95% (eller iskold vodka ~40% nødvendig).
• (d) Plastpose (zip-lock).
• (e) Tragt + filterpapir (kaffefilter).
• (f) Reagensglas eller drikkeglas.
• (g) Træpinde.

Procedure:

1.

Knus frugten — kom 1-2 jordbær i ziplock-pose, tryk al luft ud, mas i 1-2 min.

2.

Tilføj 50 ml lyseringsbuffer — knæd igen 1 min.

3.

Filtrér — gennem kaffefilter ned i et glas. ~30 ml klart lyserød væske.

4. Tilføj LANGSOMT iskold ethanol ned ad glasvæggen — 30-50 ml. Skal danne SEPARAT TOP-LAG.

5. Vent 1-3 min. DNA samles som hvidt slimet materiale ved grænsen.

6. Fisk DNA op med en træpind.

Hvorfor virker det:

1. Mekanisk knusning bryder cellevægge + cellemembraner.

2.

Salt (NaCl) — Na⁺-ionerne neutraliserer DNAs negativ-ladede phosphat-ryg → DNA klumper.

3.

Opvaskemiddel — opløser fedt-baserede membraner (cellemembraner + kerne-membraner) → frigiver DNA.

4. Filtrering fjerner store cellebrudstykker.

5.

Iskold ethanol — DNA er HYDROFIL (vandopløseligt) i den vandige fase, men er IKKE opløseligt i koldt ethanol — derfor udfældes DNA-strengene som synligt hvidt slim, når ethanol tilsættes.

Læringsmål

• Forklare princippet bag DNA-ekstraktion: cellelyse → DNA-frigørelse → udfældning med ethanol
• Forklare rollen af de tre reagenser: salt (neutraliserer DNA), opvaskemiddel (opløser membraner), kold ethanol (udfælder DNA)
• Forklare hvorfor jordbær giver godt DNA-udbytte (octoploid = 8× kromosom-sæt)
• Kende forsøgets begrænsninger: DNA er synligt som klumper, ikke som dobbeltHelix
• Skrive en korrekt forsøgsrapport med formål, metode, data, fejlkilder og konklusion

Sådan kan du arbejde med emnet

• Gentag forsøget derhjemme: 1-2 jordbær + opvaskemiddel + salt i varmt vand, filtrér, hæld iskold vodka/ethanol over — DNA er synligt!
• Sammenlign: hvad sker der hvis du bruger banan i stedet for jordbær? Diskuter resultatet med reference til genomstørrelse
• Skriv en mini-forsøgsrapport (max 1 side): formål, hvad du gjorde, hvad du så, én fejlkilde

Eksperiment-forslag

• Gennemfør DNA-ekstraktionen med jordbær derhjemme, og forklar hvert trins funktion (knusning, lyseringsbuffer, filtrering, ethanol).
• Sammenlign resultatet med et andet stykke frugt (banan eller kiwi), og diskuter forskelle i DNA-udbytte ud fra ploiditet.
• Skriv en kort forsøgsrapport (formål, metode, resultat, fejlkilde, konklusion) for forsøget.

Brobygning

Med dette forsøg har du afprøvet et af de centrale eksperimenter i biologien — næste skridt er at se på den samlede oversigt over årets forsøg i '8-10 eksperimenter over 1 år'.